Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.7 ms