Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FXNQ16595 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FXNQ16595 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FXNQ16595 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FXNQ16595 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FXNQ16595 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
FXNQ16595 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FXNQ16595 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FXNQ16595 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FXNQ16595 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FXNQ16595 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FXNQ16595 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FXNQ16595 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FXNQ16595 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FXNQ16595 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FXNQ16595 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FXNQ16595 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FXNQ16595 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FXNQ16595 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FXNQ16595 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FXNQ16595 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
FXNQ16595 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
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FXNQ16595 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FXNQ16595 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FXNQ16595 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FXNQ16595 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FXNQ16595 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FXNQ16595 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FXNQ16595 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FXNQ16595 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FXNQ16595 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FXNQ16595 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FXNQ16595 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FXNQ16595 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FXNQ16595 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FXNQ16595 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FXNQ16595 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FXNQ16595 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FXNQ16595 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FXNQ16595 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FXNQ16595 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FXNQ16595 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FXNQ16595 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FXNQ16595 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FXNQ16595 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FXNQ16595 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FXNQ16595 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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FXNQ16595 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
FXNQ16595 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
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FXNQ16595 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FXNQ16595 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FXNQ16595 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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FXNQ16595 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
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FXNQ16595 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FXNQ16595 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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FXNQ16595 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FXNQ16595 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FXNQ16595 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
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FXNQ16595 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
FXNQ16595 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
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FXNQ16595 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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FXNQ16595 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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FXNQ16595 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FXNQ16595 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
FXNQ16595 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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