Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NTRK3Q16288 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.5 ms