Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
ITSN1Q15811 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
ITSN1Q15811 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
ITSN1Q15811 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
ITSN1Q15811 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
ITSN1Q15811 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
ITSN1Q15811 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
ITSN1Q15811 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
ITSN1Q15811 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
ITSN1Q15811 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
ITSN1Q15811 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
ITSN1Q15811 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
ITSN1Q15811 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
ITSN1Q15811 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
ITSN1Q15811 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
ITSN1Q15811 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
ITSN1Q15811 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
ITSN1Q15811 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.6□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC-1.6□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC-1.6□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.6□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC-1.6□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-1.61□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC-1.61□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.65□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
ITSN1Q15811 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
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