Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
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