Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAPTM4AQ15012 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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