Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RAB39AQ14964 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
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RAB39AQ14964 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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RAB39AQ14964 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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RAB39AQ14964 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
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RAB39AQ14964 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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