Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SQLEQ14534 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.2 ms