Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
COL9A3Q14050 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
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