| RUNX2 | Q13950 | AC108516.1-201 | ENST00000503666 | 257 nt | TSL 2 BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA70.12-201 | ENST00000516084 | 153 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU1-142P-201 | ENST00000516682 | 145 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4769-201 | ENST00000584126 | 77 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL162730.1-201 | ENST00000605734 | 292 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC004832.4-201 | ENST00000608952 | 331 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PLD1-217 | ENST00000627725 | 174 nt | TSL 5 BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ATP11C-202 | ENST00000361648 | 6010 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DYNC2H1-203 | ENST00000398093 | 12945 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.569-201 | ENST00000384749 | 103 nt | BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-713P-201 | ENST00000384761 | 107 nt | BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AJ239322.2-201 | ENST00000421696 | 575 nt | TSL 5 BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | snoU13.23-201 | ENST00000458863 | 104 nt | BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC108210.2-201 | ENST00000503681 | 201 nt | BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-191P-201 | ENST00000516295 | 94 nt | BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1338P-201 | ENST00000516328 | 91 nt | BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA31.17-201 | ENST00000516953 | 127 nt | BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC091178.2-201 | ENST00000584401 | 117 nt | BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TTK-211 | ENST00000627129 | 240 nt | TSL 5 BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD114-1-201 | ENST00000362705 | 72 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.310-201 | ENST00000365063 | 113 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.461-201 | ENST00000384263 | 103 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR520A-201 | ENST00000384862 | 85 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP109-201 | ENST00000391010 | 116 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP323-201 | ENST00000391094 | 133 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP511-201 | ENST00000410487 | 115 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP338-201 | ENST00000410495 | 85 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FAR2P3-204 | ENST00000434661 | 444 nt | TSL 2 BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRBVB-201 | ENST00000477100 | 408 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC015720.1-201 | ENST00000565251 | 277 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC099850.3-201 | ENST00000577678 | 321 nt | TSL 3 BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC103810.8-201 | ENST00000607347 | 118 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SI-201 | ENST00000264382 | 6011 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OXR1-209 | ENST00000517566 | 4501 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PTPN22-206 | ENST00000525799 | 2118 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MGAT4C-207 | ENST00000552808 | 1937 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC018630.2-201 | ENST00000534866 | 2403 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA4.2-201 | ENST00000365313 | 147 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-326P-201 | ENST00000365480 | 107 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.368-201 | ENST00000365547 | 113 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00428-201 | ENST00000415620 | 227 nt | TSL 5 BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS20P10-201 | ENST00000451209 | 253 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC091021.1-201 | ENST00000468051 | 388 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL23AP42-201 | ENST00000471152 | 471 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CPHL1P-203 | ENST00000471823 | 523 nt | TSL 5 BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1278P-201 | ENST00000516130 | 107 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU2-31P-201 | ENST00000516954 | 155 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL21P9-201 | ENST00000556149 | 474 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC015712.3-201 | ENST00000559380 | 164 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL122017.1-202 | ENST00000570612 | 319 nt | TSL 5 BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF355P-201 | ENST00000427301 | 3216 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.237-201 | ENST00000364439 | 102 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA12.1-201 | ENST00000390873 | 148 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-855P-201 | ENST00000410395 | 104 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-710P-201 | ENST00000410424 | 105 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL162725.1-201 | ENST00000435405 | 301 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC116666.1-201 | ENST00000453915 | 551 nt | TSL 5 BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP57-201 | ENST00000459463 | 123 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SERF1AP1-201 | ENST00000514575 | 187 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DEFB108E-201 | ENST00000524692 | 240 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR6079-201 | ENST00000635807 | 62 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | hsa-mir-3158-1.1-201 | ENST00000637571 | 81 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KTN1-204 | ENST00000395311 | 4516 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-661P-201 | ENST00000362409 | 107 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-801P-201 | ENST00000364087 | 105 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP138-201 | ENST00000365098 | 114 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-574P-201 | ENST00000384265 | 107 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-376P-201 | ENST00000384731 | 106 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRAJ11-201 | ENST00000390526 | 60 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP000235.1-201 | ENST00000424017 | 479 nt | TSL 3 BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL591806.2-201 | ENST00000433122 | 173 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HSPE1P21-201 | ENST00000438283 | 308 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL36AP21-201 | ENST00000490372 | 323 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.668-201 | ENST00000516233 | 93 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA31.10-201 | ENST00000516482 | 106 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | uc_338.20-201 | ENST00000621563 | 178 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MT-CO2-201 | ENST00000361739 | 684 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.456-201 | ENST00000384232 | 111 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-136P-201 | ENST00000384663 | 107 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-360P-201 | ENST00000390944 | 104 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-482P-201 | ENST00000391068 | 107 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR1289-2-201 | ENST00000408360 | 111 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR1302-6-201 | ENST00000408466 | 90 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU2-14P-201 | ENST00000411053 | 191 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010154.1-201 | ENST00000425857 | 269 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HSPE1P9-201 | ENST00000440046 | 311 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS4XP11-201 | ENST00000446897 | 772 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC108752.1-201 | ENST00000484679 | 576 nt | TSL 5 BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC091959.1-201 | ENST00000495857 | 238 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP481-201 | ENST00000516814 | 122 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SCARNA24.2-201 | ENST00000516968 | 130 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC107973.1-201 | ENST00000530249 | 576 nt | TSL 4 BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4503-201 | ENST00000582187 | 83 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ST7-OT4_1.1-201 | ENST00000615322 | 200 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | C16orf97-206 | ENST00000622950 | 415 nt | TSL 2 BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008163.1-205 | ENST00000413944 | 4649 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GABRA2-209 | ENST00000510861 | 3411 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.341-201 | ENST00000365341 | 102 nt | BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRAJ41-201 | ENST00000390496 | 62 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRAJ23-201 | ENST00000390514 | 63 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |