Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
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ITGA9Q13797 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
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ITGA9Q13797 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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ITGA9Q13797 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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ITGA9Q13797 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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ITGA9Q13797 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ITGA9Q13797 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
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