Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1SQ13698 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CACNA1SQ13698 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CACNA1SQ13698 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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