Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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