Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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CUL1Q13616 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL1Q13616 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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