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| DNASE1L3 | Q13609 | AC068647.2-201 | ENST00000637380 | 353 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| DNASE1L3 | Q13609 | NEDD4-205 | ENST00000506154 | 6751 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| DNASE1L3 | Q13609 | AC134026.1-201 | ENST00000623249 | 2239 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
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| DNASE1L3 | Q13609 | AC104332.1-201 | ENST00000440471 | 797 nt | BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| DNASE1L3 | Q13609 | LINC02276-201 | ENST00000508388 | 138 nt | TSL 3 BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| DNASE1L3 | Q13609 | RNU7-193P-201 | ENST00000516723 | 65 nt | BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| DNASE1L3 | Q13609 | AC024995.1-201 | ENST00000523014 | 93 nt | BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| DNASE1L3 | Q13609 | AC015720.1-201 | ENST00000565251 | 277 nt | BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| DNASE1L3 | Q13609 | DEFB122-202 | ENST00000569013 | 197 nt | BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| DNASE1L3 | Q13609 | MIR5692C2-201 | ENST00000577959 | 77 nt | BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| DNASE1L3 | Q13609 | POLR3GP1-201 | ENST00000594073 | 261 nt | BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| DNASE1L3 | Q13609 | Hammerhead_HH9.1-201 | ENST00000616606 | 77 nt | BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| DNASE1L3 | Q13609 | ASPN-202 | ENST00000375544 | 2470 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| DNASE1L3 | Q13609 | Y_RNA.199-201 | ENST00000364014 | 102 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| DNASE1L3 | Q13609 | Y_RNA.293-201 | ENST00000364908 | 93 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| DNASE1L3 | Q13609 | RNU6-1323P-201 | ENST00000384025 | 107 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| DNASE1L3 | Q13609 | SNORA64-201 | ENST00000384674 | 134 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| DNASE1L3 | Q13609 | AC005703.2-201 | ENST00000453339 | 343 nt | TSL 2 BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| DNASE1L3 | Q13609 | RNU6-717P-201 | ENST00000459076 | 104 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| DNASE1L3 | Q13609 | RNU7-115P-201 | ENST00000516433 | 55 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| DNASE1L3 | Q13609 | RNU7-116P-201 | ENST00000516940 | 62 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| DNASE1L3 | Q13609 | AC009930.1-201 | ENST00000522330 | 191 nt | TSL 5 BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| DNASE1L3 | Q13609 | AC130289.1-201 | ENST00000577321 | 73 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| DNASE1L3 | Q13609 | MIR4448-201 | ENST00000584360 | 86 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| DNASE1L3 | Q13609 | AC245884.12-201 | ENST00000615364 | 59 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| DNASE1L3 | Q13609 | MIR548AY-201 | ENST00000617669 | 107 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |