Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
LSAMPQ13449 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.58□□□□□ -2
LSAMPQ13449 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LSAMPQ13449 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LSAMPQ13449 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LSAMPQ13449 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LSAMPQ13449 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LSAMPQ13449 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LSAMPQ13449 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LSAMPQ13449 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LSAMPQ13449 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LSAMPQ13449 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
LSAMPQ13449 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
LSAMPQ13449 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LSAMPQ13449 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LSAMPQ13449 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LSAMPQ13449 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LSAMPQ13449 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
LSAMPQ13449 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LSAMPQ13449 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
LSAMPQ13449 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LSAMPQ13449 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LSAMPQ13449 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LSAMPQ13449 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LSAMPQ13449 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
LSAMPQ13449 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LSAMPQ13449 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LSAMPQ13449 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LSAMPQ13449 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LSAMPQ13449 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LSAMPQ13449 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LSAMPQ13449 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
LSAMPQ13449 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
LSAMPQ13449 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LSAMPQ13449 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LSAMPQ13449 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LSAMPQ13449 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LSAMPQ13449 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LSAMPQ13449 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LSAMPQ13449 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LSAMPQ13449 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LSAMPQ13449 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
LSAMPQ13449 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LSAMPQ13449 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LSAMPQ13449 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
LSAMPQ13449 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LSAMPQ13449 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
LSAMPQ13449 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
LSAMPQ13449 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
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