Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
MSLNQ13421 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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