Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MRPL49Q13405 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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