Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KLF1Q13351 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KLF1Q13351 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KLF1Q13351 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KLF1Q13351 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KLF1Q13351 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KLF1Q13351 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KLF1Q13351 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KLF1Q13351 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KLF1Q13351 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KLF1Q13351 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KLF1Q13351 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KLF1Q13351 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KLF1Q13351 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KLF1Q13351 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KLF1Q13351 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KLF1Q13351 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KLF1Q13351 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KLF1Q13351 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KLF1Q13351 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KLF1Q13351 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KLF1Q13351 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KLF1Q13351 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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