Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIM28Q13263 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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