Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RESTQ13127 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RESTQ13127 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RESTQ13127 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RESTQ13127 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RESTQ13127 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RESTQ13127 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RESTQ13127 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RESTQ13127 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RESTQ13127 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RESTQ13127 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RESTQ13127 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RESTQ13127 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RESTQ13127 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RESTQ13127 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RESTQ13127 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RESTQ13127 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RESTQ13127 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RESTQ13127 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RESTQ13127 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RESTQ13127 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RESTQ13127 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RESTQ13127 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RESTQ13127 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RESTQ13127 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RESTQ13127 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RESTQ13127 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RESTQ13127 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RESTQ13127 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RESTQ13127 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RESTQ13127 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RESTQ13127 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RESTQ13127 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RESTQ13127 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RESTQ13127 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RESTQ13127 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RESTQ13127 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RESTQ13127 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RESTQ13127 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RESTQ13127 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RESTQ13127 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RESTQ13127 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RESTQ13127 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RESTQ13127 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RESTQ13127 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RESTQ13127 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RESTQ13127 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RESTQ13127 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RESTQ13127 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RESTQ13127 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RESTQ13127 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RESTQ13127 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RESTQ13127 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RESTQ13127 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RESTQ13127 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RESTQ13127 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RESTQ13127 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RESTQ13127 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RESTQ13127 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RESTQ13127 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RESTQ13127 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RESTQ13127 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RESTQ13127 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RESTQ13127 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RESTQ13127 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RESTQ13127 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.1 ms