Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
DUSP4Q13115 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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DUSP4Q13115 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DUSP4Q13115 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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