Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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