Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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FOXF2Q12947 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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FOXF2Q12947 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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FOXF2Q12947 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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