Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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SH3BP1Q9Y3L3 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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SH3BP1Q9Y3L3 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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SH3BP1Q9Y3L3 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
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SH3BP1Q9Y3L3 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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SH3BP1Q9Y3L3 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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