Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
PGPEP1Q9NXJ5 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PGPEP1Q9NXJ5 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PGPEP1Q9NXJ5 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PGPEP1Q9NXJ5 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PGPEP1Q9NXJ5 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PGPEP1Q9NXJ5 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PGPEP1Q9NXJ5 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PGPEP1Q9NXJ5 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PGPEP1Q9NXJ5 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PGPEP1Q9NXJ5 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PGPEP1Q9NXJ5 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PGPEP1Q9NXJ5 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PGPEP1Q9NXJ5 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PGPEP1Q9NXJ5 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PGPEP1Q9NXJ5 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PGPEP1Q9NXJ5 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PGPEP1Q9NXJ5 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PGPEP1Q9NXJ5 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PGPEP1Q9NXJ5 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PGPEP1Q9NXJ5 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PGPEP1Q9NXJ5 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PGPEP1Q9NXJ5 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PGPEP1Q9NXJ5 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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