Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC0.08□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
UBQLN4Q9NRR5 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
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