Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SPOCK3Q9BQ16 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SPOCK3Q9BQ16 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms