Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
VAT1Q99536 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
VAT1Q99536 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
VAT1Q99536 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
VAT1Q99536 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
VAT1Q99536 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VAT1Q99536 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VAT1Q99536 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VAT1Q99536 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VAT1Q99536 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VAT1Q99536 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VAT1Q99536 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VAT1Q99536 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VAT1Q99536 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
VAT1Q99536 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
VAT1Q99536 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VAT1Q99536 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VAT1Q99536 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VAT1Q99536 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VAT1Q99536 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms