Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCBE1Q6UXH8 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
CCBE1Q6UXH8 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCBE1Q6UXH8 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCBE1Q6UXH8 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCBE1Q6UXH8 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCBE1Q6UXH8 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCBE1Q6UXH8 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCBE1Q6UXH8 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCBE1Q6UXH8 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCBE1Q6UXH8 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCBE1Q6UXH8 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCBE1Q6UXH8 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCBE1Q6UXH8 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCBE1Q6UXH8 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCBE1Q6UXH8 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCBE1Q6UXH8 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCBE1Q6UXH8 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCBE1Q6UXH8 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCBE1Q6UXH8 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CCBE1Q6UXH8 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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