Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.13
CTU2Q2VPK5 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CTU2Q2VPK5 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CTU2Q2VPK5 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CTU2Q2VPK5 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CTU2Q2VPK5 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CTU2Q2VPK5 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CTU2Q2VPK5 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CTU2Q2VPK5 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CTU2Q2VPK5 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CTU2Q2VPK5 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CTU2Q2VPK5 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CTU2Q2VPK5 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CTU2Q2VPK5 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CTU2Q2VPK5 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CTU2Q2VPK5 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CTU2Q2VPK5 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CTU2Q2VPK5 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CTU2Q2VPK5 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CTU2Q2VPK5 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CTU2Q2VPK5 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CTU2Q2VPK5 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CTU2Q2VPK5 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CTU2Q2VPK5 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CTU2Q2VPK5 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CTU2Q2VPK5 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CTU2Q2VPK5 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CTU2Q2VPK5 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CTU2Q2VPK5 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.3 ms