Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CSPP1Q1MSJ5 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CSPP1Q1MSJ5 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CSPP1Q1MSJ5 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSPP1Q1MSJ5 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSPP1Q1MSJ5 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSPP1Q1MSJ5 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSPP1Q1MSJ5 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSPP1Q1MSJ5 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSPP1Q1MSJ5 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
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