Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.41□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
KNOP1Q1ED39 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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