Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
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PTPRNQ16849 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
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PTPRNQ16849 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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PTPRNQ16849 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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PTPRNQ16849 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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PTPRNQ16849 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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PTPRNQ16849 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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PTPRNQ16849 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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PTPRNQ16849 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
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PTPRNQ16849 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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PTPRNQ16849 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
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