Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ME3Q16798 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ME3Q16798 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ME3Q16798 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ME3Q16798 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ME3Q16798 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ME3Q16798 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ME3Q16798 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ME3Q16798 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ME3Q16798 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ME3Q16798 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ME3Q16798 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ME3Q16798 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ME3Q16798 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ME3Q16798 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ME3Q16798 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ME3Q16798 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ME3Q16798 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ME3Q16798 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ME3Q16798 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ME3Q16798 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ME3Q16798 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ME3Q16798 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ME3Q16798 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ME3Q16798 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ME3Q16798 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ME3Q16798 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ME3Q16798 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ME3Q16798 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ME3Q16798 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ME3Q16798 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ME3Q16798 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ME3Q16798 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ME3Q16798 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ME3Q16798 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ME3Q16798 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
ME3Q16798 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ME3Q16798 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ME3Q16798 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ME3Q16798 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ME3Q16798 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ME3Q16798 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ME3Q16798 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ME3Q16798 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ME3Q16798 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ME3Q16798 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ME3Q16798 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ME3Q16798 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ME3Q16798 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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ME3Q16798 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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ME3Q16798 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ME3Q16798 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ME3Q16798 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ME3Q16798 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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ME3Q16798 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ME3Q16798 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ME3Q16798 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ME3Q16798 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ME3Q16798 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ME3Q16798 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ME3Q16798 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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ME3Q16798 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ME3Q16798 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ME3Q16798 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ME3Q16798 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ME3Q16798 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ME3Q16798 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ME3Q16798 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ME3Q16798 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ME3Q16798 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ME3Q16798 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ME3Q16798 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ME3Q16798 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ME3Q16798 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ME3Q16798 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ME3Q16798 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ME3Q16798 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ME3Q16798 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ME3Q16798 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ME3Q16798 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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