Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207 ms