Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FXNQ16595 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FXNQ16595 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FXNQ16595 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FXNQ16595 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FXNQ16595 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FXNQ16595 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FXNQ16595 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FXNQ16595 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FXNQ16595 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FXNQ16595 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FXNQ16595 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FXNQ16595 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FXNQ16595 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FXNQ16595 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FXNQ16595 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FXNQ16595 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FXNQ16595 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FXNQ16595 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FXNQ16595 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FXNQ16595 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FXNQ16595 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FXNQ16595 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FXNQ16595 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FXNQ16595 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FXNQ16595 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FXNQ16595 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
FXNQ16595 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
FXNQ16595 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FXNQ16595 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FXNQ16595 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FXNQ16595 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FXNQ16595 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FXNQ16595 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FXNQ16595 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FXNQ16595 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FXNQ16595 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FXNQ16595 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FXNQ16595 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FXNQ16595 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FXNQ16595 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FXNQ16595 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FXNQ16595 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FXNQ16595 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FXNQ16595 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FXNQ16595 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FXNQ16595 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FXNQ16595 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FXNQ16595 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FXNQ16595 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FXNQ16595 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FXNQ16595 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FXNQ16595 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FXNQ16595 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FXNQ16595 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FXNQ16595 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FXNQ16595 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FXNQ16595 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FXNQ16595 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FXNQ16595 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FXNQ16595 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FXNQ16595 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FXNQ16595 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FXNQ16595 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FXNQ16595 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FXNQ16595 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FXNQ16595 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FXNQ16595 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FXNQ16595 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FXNQ16595 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FXNQ16595 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FXNQ16595 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FXNQ16595 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FXNQ16595 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FXNQ16595 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FXNQ16595 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FXNQ16595 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FXNQ16595 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FXNQ16595 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FXNQ16595 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FXNQ16595 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FXNQ16595 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FXNQ16595 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FXNQ16595 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FXNQ16595 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FXNQ16595 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FXNQ16595 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FXNQ16595 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FXNQ16595 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FXNQ16595 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FXNQ16595 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FXNQ16595 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FXNQ16595 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
FXNQ16595 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
FXNQ16595 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FXNQ16595 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FXNQ16595 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FXNQ16595 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FXNQ16595 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FXNQ16595 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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