| FXN | Q16595 | Y_RNA.464-201 | ENST00000384282 | 110 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | MT-TT-201 | ENST00000387460 | 66 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | MIR1278-201 | ENST00000408753 | 81 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | RNA5SP270-201 | ENST00000411361 | 118 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | RN7SL863P-201 | ENST00000462370 | 296 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | TRBV12-1-201 | ENST00000479785 | 344 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | AC004486.1-201 | ENST00000546846 | 233 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | UBL5P2-201 | ENST00000583788 | 219 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | AC091178.2-201 | ENST00000584401 | 117 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
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| FXN | Q16595 | AC130466.1-201 | ENST00000636354 | 4683 nt | TSL 5 BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
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| FXN | Q16595 | MCF2-208 | ENST00000519895 | 3346 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 2.76 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | TAB2-201 | ENST00000367456 | 4553 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.76 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | Y_RNA.75-201 | ENST00000362927 | 97 nt | BASIC | 2.76 | □□□□□ -1.97 | | |
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| FXN | Q16595 | RNU6-578P-201 | ENST00000390980 | 103 nt | BASIC | 2.76 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | HMGN2P39-201 | ENST00000398005 | 273 nt | BASIC | 2.76 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | AL512604.1-201 | ENST00000404812 | 257 nt | BASIC | 2.76 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | RPS26P45-201 | ENST00000471748 | 340 nt | BASIC | 2.76 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | RN7SL504P-201 | ENST00000494496 | 287 nt | BASIC | 2.76 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | AP003097.2-201 | ENST00000530126 | 178 nt | TSL 3 BASIC | 2.76 | □□□□□ -1.97 | | |
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| FXN | Q16595 | KTN1-204 | ENST00000395311 | 4516 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.76 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | TAB3-203 | ENST00000378930 | 6255 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.76 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | OR2J3-203 | ENST00000641960 | 3342 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.75 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | PIK3CA-201 | ENST00000263967 | 9093 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.75 | □□□□□ -1.97 | | |
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| FXN | Q16595 | PPIP5K2-203 | ENST00000414217 | 5842 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.75 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | RNU6-312P-201 | ENST00000364629 | 107 nt | BASIC | 2.74 | □□□□□ -1.97 | | |
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| FXN | Q16595 | RNA5SP496-201 | ENST00000391240 | 109 nt | BASIC | 2.74 | □□□□□ -1.97 | | |
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| FXN | Q16595 | AC118755.2-201 | ENST00000584676 | 212 nt | TSL 3 BASIC | 2.74 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | AL355376.2-201 | ENST00000603866 | 267 nt | TSL 5 BASIC | 2.74 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | MIR8057-201 | ENST00000620957 | 69 nt | BASIC | 2.74 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | PCNP-208 | ENST00000627393 | 136 nt | TSL 2 BASIC | 2.74 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | TBC1D31-214 | ENST00000522420 | 3167 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | CEP57L1-201 | ENST00000359793 | 2515 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | MIR22-201 | ENST00000362190 | 85 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | Y_RNA.23-201 | ENST00000362496 | 106 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | RNU1-52P-201 | ENST00000384190 | 164 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
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| FXN | Q16595 | RNU6-1228P-201 | ENST00000391014 | 107 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | RNA5SP465-201 | ENST00000391195 | 109 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | AL603908.1-201 | ENST00000406098 | 201 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
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| FXN | Q16595 | ARHGAP15-202 | ENST00000409869 | 2968 nt | TSL 5 BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | RN7SKP57-201 | ENST00000517248 | 293 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | AC109810.1-201 | ENST00000534066 | 224 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
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| FXN | Q16595 | AC138625.2-201 | ENST00000563968 | 551 nt | TSL 3 BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
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| FXN | Q16595 | LINC01900-203 | ENST00000585185 | 393 nt | TSL 3 BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | AC069114.2-201 | ENST00000604699 | 304 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | AL365434.2-201 | ENST00000607979 | 234 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | AC104465.1-201 | ENST00000611365 | 139 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | OSTN-202 | ENST00000445281 | 3134 nt | TSL 5 BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | CACNB4-238 | ENST00000636901 | 7706 nt | TSL 5 BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | LCOR-205 | ENST00000421806 | 16004 nt | TSL 3 BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | SNORA3A-201 | ENST00000364113 | 130 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | MIR512-1-201 | ENST00000384913 | 84 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | RN7SKP101-201 | ENST00000411376 | 320 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | UBE2Q2P12-201 | ENST00000414573 | 204 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | SEPT7P4-201 | ENST00000437076 | 306 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | SNORA9.3-201 | ENST00000516383 | 129 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | SNORA70.24-201 | ENST00000517233 | 118 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | AC107958.3-201 | ENST00000553410 | 431 nt | TSL 3 BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | MIR3670-2-201 | ENST00000582974 | 65 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | MIR3605-201 | ENST00000583214 | 100 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | MIR3670-1-201 | ENST00000584160 | 65 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | MIR3670-3-201 | ENST00000584855 | 65 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | MIR3670-4-201 | ENST00000612260 | 65 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | AC023490.3-201 | ENST00000621762 | 358 nt | TSL 3 BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | AP000550.4-201 | ENST00000639507 | 358 nt | TSL 3 BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | RICTOR-202 | ENST00000357387 | 9543 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.97 | | |
| FXN | Q16595 | SLC39A10-201 | ENST00000359634 | 5322 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| FXN | Q16595 | RNA5SP374-201 | ENST00000362939 | 125 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| FXN | Q16595 | RNU6-1209P-201 | ENST00000363655 | 107 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| FXN | Q16595 | Y_RNA.357-201 | ENST00000365487 | 109 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| FXN | Q16595 | Y_RNA.587-201 | ENST00000391210 | 103 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| FXN | Q16595 | AL121914.1-201 | ENST00000450188 | 156 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| FXN | Q16595 | IGLV3-17-201 | ENST00000519099 | 244 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |