Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SLC18A3Q16572 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SLC18A3Q16572 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SLC18A3Q16572 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SLC18A3Q16572 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SLC18A3Q16572 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SLC18A3Q16572 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SLC18A3Q16572 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SLC18A3Q16572 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SLC18A3Q16572 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SLC18A3Q16572 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SLC18A3Q16572 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SLC18A3Q16572 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SLC18A3Q16572 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SLC18A3Q16572 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SLC18A3Q16572 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SLC18A3Q16572 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SLC18A3Q16572 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SLC18A3Q16572 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SLC18A3Q16572 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SLC18A3Q16572 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SLC18A3Q16572 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SLC18A3Q16572 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SLC18A3Q16572 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SLC18A3Q16572 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SLC18A3Q16572 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SLC18A3Q16572 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SLC18A3Q16572 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SLC18A3Q16572 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SLC18A3Q16572 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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