Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
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RPE65Q16518 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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RPE65Q16518 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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RPE65Q16518 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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RPE65Q16518 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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RPE65Q16518 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
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