Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NTRK3Q16288 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NTRK3Q16288 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.6 ms