Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPS72Q15906 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPS72Q15906 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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