Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.09
SMAD1Q15797 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMAD1Q15797 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMAD1Q15797 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMAD1Q15797 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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