Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23AQ15436 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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