Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SF3B3Q15393 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SF3B3Q15393 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SF3B3Q15393 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SF3B3Q15393 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SF3B3Q15393 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SF3B3Q15393 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SF3B3Q15393 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SF3B3Q15393 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SF3B3Q15393 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SF3B3Q15393 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SF3B3Q15393 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SF3B3Q15393 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF3B3Q15393 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF3B3Q15393 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF3B3Q15393 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF3B3Q15393 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF3B3Q15393 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF3B3Q15393 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SF3B3Q15393 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF3B3Q15393 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SF3B3Q15393 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF3B3Q15393 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF3B3Q15393 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF3B3Q15393 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SF3B3Q15393 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF3B3Q15393 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF3B3Q15393 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF3B3Q15393 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF3B3Q15393 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF3B3Q15393 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SF3B3Q15393 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SF3B3Q15393 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SF3B3Q15393 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SF3B3Q15393 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SF3B3Q15393 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SF3B3Q15393 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SF3B3Q15393 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SF3B3Q15393 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SF3B3Q15393 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SF3B3Q15393 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SF3B3Q15393 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SF3B3Q15393 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SF3B3Q15393 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SF3B3Q15393 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
SF3B3Q15393 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SF3B3Q15393 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SF3B3Q15393 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SF3B3Q15393 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SF3B3Q15393 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SF3B3Q15393 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SF3B3Q15393 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SF3B3Q15393 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SF3B3Q15393 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SF3B3Q15393 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SF3B3Q15393 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SF3B3Q15393 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SF3B3Q15393 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SF3B3Q15393 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SF3B3Q15393 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SF3B3Q15393 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SF3B3Q15393 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SF3B3Q15393 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SF3B3Q15393 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SF3B3Q15393 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SF3B3Q15393 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SF3B3Q15393 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SF3B3Q15393 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SF3B3Q15393 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SF3B3Q15393 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SF3B3Q15393 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SF3B3Q15393 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SF3B3Q15393 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF3B3Q15393 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF3B3Q15393 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF3B3Q15393 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF3B3Q15393 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF3B3Q15393 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF3B3Q15393 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF3B3Q15393 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF3B3Q15393 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF3B3Q15393 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF3B3Q15393 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF3B3Q15393 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF3B3Q15393 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SF3B3Q15393 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SF3B3Q15393 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF3B3Q15393 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF3B3Q15393 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF3B3Q15393 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF3B3Q15393 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF3B3Q15393 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SF3B3Q15393 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SF3B3Q15393 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SF3B3Q15393 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SF3B3Q15393 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SF3B3Q15393 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SF3B3Q15393 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SF3B3Q15393 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SF3B3Q15393 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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