Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PRKD1Q15139 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PRKD1Q15139 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PRKD1Q15139 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PRKD1Q15139 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PRKD1Q15139 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PRKD1Q15139 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PRKD1Q15139 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PRKD1Q15139 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PRKD1Q15139 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PRKD1Q15139 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PRKD1Q15139 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PRKD1Q15139 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PRKD1Q15139 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PRKD1Q15139 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PRKD1Q15139 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PRKD1Q15139 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
PRKD1Q15139 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PRKD1Q15139 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.5 ms