Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209 ms