Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GBX1Q14549 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.5 ms