| RUNX2 | Q13950 | KIF20B-202 | ENST00000371728 | 6419 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FSIP2-206 | ENST00000611759 | 3882 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010615.1-201 | ENST00000594254 | 1764 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU4-90P-201 | ENST00000362773 | 141 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-238P-201 | ENST00000363313 | 106 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-271P-201 | ENST00000363858 | 105 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.383-201 | ENST00000383855 | 97 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-472P-201 | ENST00000384299 | 107 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRAJ48-201 | ENST00000390489 | 63 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01701-201 | ENST00000419614 | 451 nt | TSL 2 BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL135790.2-201 | ENST00000437701 | 267 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL606517.2-201 | ENST00000442855 | 241 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC097501.2-201 | ENST00000502668 | 305 nt | TSL 5 BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR514B-201 | ENST00000516774 | 80 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC084364.2-201 | ENST00000546924 | 395 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR5089-201 | ENST00000580047 | 84 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC002984.1-201 | ENST00000591692 | 448 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR8062-201 | ENST00000621515 | 85 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | 5S_rRNA.13-201 | ENST00000622298 | 123 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC068631.1-220 | ENST00000630726 | 256 nt | TSL 5 BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TPTE2-204 | ENST00000400103 | 1652 nt | TSL 5 BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SAGE1-201 | ENST00000324447 | 2952 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TDRD15-202 | ENST00000622654 | 5805 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL359851.1-201 | ENST00000569460 | 4997 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.16-201 | ENST00000362421 | 102 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.47-201 | ENST00000362697 | 108 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-112P-201 | ENST00000363599 | 104 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-324P-201 | ENST00000363957 | 106 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA63D-201 | ENST00000364359 | 132 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1019P-201 | ENST00000364424 | 107 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-290P-201 | ENST00000365212 | 101 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP37-201 | ENST00000365420 | 130 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.376-201 | ENST00000365638 | 108 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MT-TW-201 | ENST00000387382 | 68 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1186P-201 | ENST00000410429 | 97 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1203P-201 | ENST00000410703 | 110 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC073323.1-201 | ENST00000419832 | 451 nt | TSL 2 BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCYBP9-201 | ENST00000431021 | 303 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TTTY16-201 | ENST00000437686 | 192 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL23AP6-201 | ENST00000446637 | 472 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC025033.1-201 | ENST00000463883 | 194 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HMGN1P10-201 | ENST00000474557 | 553 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL163195.1-201 | ENST00000496941 | 348 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MRPS17P9-201 | ENST00000511924 | 393 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCO2P24-201 | ENST00000515611 | 426 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU7-99P-201 | ENST00000516271 | 62 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1337P-201 | ENST00000516525 | 95 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC024995.1-201 | ENST00000523014 | 93 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC087518.1-201 | ENST00000524098 | 187 nt | TSL 3 BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL035078.1-202 | ENST00000531627 | 413 nt | TSL 2 BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL161670.1-201 | ENST00000554348 | 137 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DEFB122-202 | ENST00000569013 | 197 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNRPGP19-201 | ENST00000603826 | 189 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL359075.3-201 | ENST00000613288 | 217 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SLC25A46-204 | ENST00000504098 | 2345 nt | TSL 5 BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LRRCC1-202 | ENST00000414626 | 4493 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL356292.1-201 | ENST00000283110 | 373 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.136-201 | ENST00000363444 | 102 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00583-201 | ENST00000381010 | 387 nt | TSL 2 BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD116-13-201 | ENST00000384408 | 92 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU2-40P-201 | ENST00000410833 | 196 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC023051.1-201 | ENST00000414098 | 876 nt | TSL 5 BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND3P2-201 | ENST00000438452 | 342 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS27P1-201 | ENST00000450552 | 247 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL23AP63-201 | ENST00000498752 | 471 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-63P-201 | ENST00000516690 | 95 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU1-40P-201 | ENST00000516816 | 164 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU1-97P-201 | ENST00000516872 | 164 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-570P-201 | ENST00000517051 | 105 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP437-201 | ENST00000517249 | 129 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP001282.2-201 | ENST00000616149 | 309 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC245060.5-201 | ENST00000610778 | 3293 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NEDD1-204 | ENST00000457368 | 3162 nt | TSL 2 BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SAGE1-202 | ENST00000370709 | 2879 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU4-80P-201 | ENST00000363200 | 141 nt | BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.176-201 | ENST00000363815 | 109 nt | BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.396-201 | ENST00000383949 | 103 nt | BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.483-201 | ENST00000384380 | 101 nt | BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.518-201 | ENST00000384552 | 113 nt | BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | POLR2KP2-201 | ENST00000438155 | 177 nt | BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HSPE1P13-201 | ENST00000451143 | 297 nt | BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU7-172P-201 | ENST00000517125 | 64 nt | BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4713-201 | ENST00000582691 | 75 nt | BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4448-201 | ENST00000584360 | 86 nt | BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC073413.2-201 | ENST00000604332 | 360 nt | BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC022217.4-201 | ENST00000604389 | 163 nt | BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP000553.5-201 | ENST00000641933 | 54 nt | BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007370.2-201 | ENST00000506899 | 2694 nt | TSL 5 BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FSD1L-201 | ENST00000374707 | 7062 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MUC15-202 | ENST00000436318 | 3118 nt | TSL 5 BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SERPINI2-207 | ENST00000476257 | 1837 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092881.1-201 | ENST00000638218 | 2733 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MUC15-203 | ENST00000455601 | 3156 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.149-201 | ENST00000363558 | 117 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | snosnR66.1-201 | ENST00000391095 | 99 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6ATAC38P-201 | ENST00000408119 | 126 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCO1P5-201 | ENST00000433573 | 344 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC069257.2-201 | ENST00000441819 | 155 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01594-201 | ENST00000445083 | 611 nt | TSL 5 BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-717P-201 | ENST00000459076 | 104 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |