Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCINQ13939 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCINQ13939 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCINQ13939 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCINQ13939 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCINQ13939 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCINQ13939 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCINQ13939 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCINQ13939 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCINQ13939 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCINQ13939 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCINQ13939 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCINQ13939 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCINQ13939 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCINQ13939 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCINQ13939 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCINQ13939 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCINQ13939 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCINQ13939 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCINQ13939 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCINQ13939 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCINQ13939 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCINQ13939 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCINQ13939 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCINQ13939 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCINQ13939 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCINQ13939 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCINQ13939 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCINQ13939 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCINQ13939 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCINQ13939 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCINQ13939 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCINQ13939 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCINQ13939 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCINQ13939 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCINQ13939 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCINQ13939 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCINQ13939 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCINQ13939 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCINQ13939 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCINQ13939 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCINQ13939 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCINQ13939 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCINQ13939 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCINQ13939 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCINQ13939 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCINQ13939 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCINQ13939 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCINQ13939 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCINQ13939 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCINQ13939 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCINQ13939 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCINQ13939 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCINQ13939 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCINQ13939 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCINQ13939 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCINQ13939 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCINQ13939 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCINQ13939 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCINQ13939 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCINQ13939 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCINQ13939 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCINQ13939 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCINQ13939 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCINQ13939 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CCINQ13939 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CCINQ13939 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CCINQ13939 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCINQ13939 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCINQ13939 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCINQ13939 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCINQ13939 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CCINQ13939 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCINQ13939 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCINQ13939 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCINQ13939 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCINQ13939 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCINQ13939 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCINQ13939 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CCINQ13939 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCINQ13939 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CCINQ13939 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CCINQ13939 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CCINQ13939 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CCINQ13939 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms