Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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